解決策
FTP Serverのソフトウェアは、カスタムでインストールする必要があります。
Linuxのベースシステムイメージを既にインストールしている場合、compactRIOターゲットを一度
フォーマットして から、新たにソフトウェアをインストールする際に
カスタムソフトウェアインストールを選択します。
表示される画面で
Legacy FTP Serverを選択してcompactRIOにインストールします。
例えば下の図のような表示の場合、
LabVIEW Real-Timeの項目の下に見つけることができます。