解決策
作成したアプリケーションをSystemLink Web Applicationとしてインストールすると、NI Web Serverがホストしているコンポーネントが保存されている下記のパスの
pluginsのフォルダに設定ファイルによって指定された名前のフォルダ(テンプレートのデフォルトは
webvi_plugin)が作成されます。
C:\Program Files\National Instruments\Shared\Web Server\htdocsこのフォルダ名を変更することで複数のWeb Applicationをインストールする事ができます。
下記5点の設定ファイルの赤枠部分をデフォルトの名前から変更する必要があります。ここではデフォルトのは
webvi_pluginからは
webvi_plugin0に変更しています。
webvi_plugin0はインストール先のフォルダ名、
WebApp0はSystemLink Web Applicationの表示名となります。